猪呼吸与繁殖综合征（蓝耳病）是具有高度遗传变异性的RNA病毒，近年来给养猪业带来巨大经济损失，是一个非常难以对付的病毒。II型蓝耳病（或称北美型）最早于1987年在美国报道，我国在1996年发现。但是迄今该病毒的系统发育和重组特性并没有被完全了解。最近，华中农业大学团队对901个II型蓝耳病毒的全基因组序列进行了综合分析，以揭示其进化动态。

　系统发育树结果显示，蓝耳病完整基因组可以分为三个独立的基因分组，L1，L2和L3。L2和L3序列作为不同年份的优势谱系占很大比例。该团队计算遗传多样性发现，L2和L3蓝耳病毒的遗传多样性完全不同，说明L2和L3可能收到了不同的进化事件影响。然后他们分析了产生这种现象可能的原因，得出了一些关于蓝耳病流行趋势的新见解。

　从分子进化动力学的角度看，以当前正在流行的NADC30为代表的L2.7正在经历遗传多样性减少，符合在一场流行爆发之前某个亚系会因其成为主导而多样性下降的趋势。因此研究者预测，在不久之后将会发生一次L2.7爆发。

　此外，L3.7与L2.7经历了类似的进化事件，并在在中国猪群中保持稳定。研究者认为应当注意防范具有高替换率模式的病毒，并期望通过对于一些谱系（L2.7，L3.7）的检测，来预测高替换率蓝耳新毒株的出现。另外国内虽然已有商用弱毒苗广泛使用，但使用效果很差，蓝儿病毒的多样性和复杂性进一步增加，而研究数据则有望用于疫苗的筛选和开发。

　对于重组特性的研究显示，不同基因分组的蓝耳病毒变现出明显不同。L2的重组复杂，内外重组都有，而L3相对单一，主要是内部重组。L2重组非常活跃，特别是L2.7，