在蓝耳病的防控中，需要结合其发展规律，在实践中摸索合适的方案。
1、降低猪场病原含量：研究显示在多毒株感染的自繁场，控制蓝耳病毒非常困难。在蓝耳病控制中，首先要避免引入新的毒株，在种猪引种时需要尤其注意。在繁育场的生产系统中，对各阶段猪群进行血清学监测，有助于全面了解病毒的流行情况。有条件的国家通过监测—清除阳性猪群可以慢慢达到清除蓝耳病毒的目的，但国内还不具备条件。猪场的全进全出、彻底的空栏消毒以及分点式饲养等手段能有效的降低病原含量，并阻止传播。通过疫苗控制时，可以考虑降低母猪的免疫频率和减少仔猪的免疫剂量，以减少疫苗的毒副作用。更换蓝耳疫苗需要慎重，与免疫的上一种疫苗至少有4个月的间隔，且先小试以确定安全性为佳。
2、控制协同或继发感染病原：蓝耳病毒容易与猪瘟、圆环等病毒协同感染，以及容易引起副猪嗜血杆菌、链球菌等继发性感染。圆环病毒、链球菌和副猪嗜血杆菌都可以通过有效的疫苗免疫，进行控制。当协同或继发感染得到有效控制时，能大大降低蓝耳病引起的损失。
3、提升机体免疫力：在不稳定猪场中总有一部分猪对蓝耳病毒没有建立起抵抗力，所以导致疾病发生。急性感染中若猪群同时暴露于病毒的感染下，能使感染周期变得一致，使疾病更易控制，但前提是感染前的猪群处于良好的状态，继发感染压力较小，猪群有较好的免疫力。在蓝耳不稳定场通过长期的中药保健能有效提高猪群的免疫力，如通过母猪群添加黄芪多糖、芪板青颗粒、感得康颗粒、驱疫健等中药，能逐步提高猪群的免疫力，建立对蓝耳病毒的抵抗。
